Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4CQ96DT6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms