Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4DQ92854 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4DQ92854 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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