Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
UBXN4Q92575 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms