Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX33Q8WV41 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX33Q8WV41 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX33Q8WV41 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX33Q8WV41 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX33Q8WV41 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX33Q8WV41 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX33Q8WV41 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX33Q8WV41 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX33Q8WV41 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX33Q8WV41 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX33Q8WV41 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms