Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FNDC9Q8TBE3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms