Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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CNNM3Q8NE01 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CNNM3Q8NE01 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNNM3Q8NE01 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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