Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms