Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC18Q8N456 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC18Q8N456 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC18Q8N456 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC18Q8N456 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC18Q8N456 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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LRRC18Q8N456 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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LRRC18Q8N456 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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LRRC18Q8N456 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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LRRC18Q8N456 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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LRRC18Q8N456 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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LRRC18Q8N456 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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