Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2LQ8IYA6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms