Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC83Q8IWF9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms