Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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