Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAPQ7Z569 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms