Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms