Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC80Q76M96 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms