Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms