Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL4Q6XD76 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms