Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms