Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATL3Q6DD88 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms