Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms