Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms