Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BEND3Q5T5X7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND3Q5T5X7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms