Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms