Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms