Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms