Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms