Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms