Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRNQ4KMQ1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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