Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms