Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms