Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms