Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF8Q3BBV2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms