Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
FHOD3Q2V2M9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FHOD3Q2V2M9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms