Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICAQ29983 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MICAQ29983 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MICAQ29983 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MICAQ29983 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
MICAQ29983 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MICAQ29983 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MICAQ29983 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICAQ29983 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MICAQ29983 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MICAQ29983 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms