Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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