Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME3Q16798 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME3Q16798 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME3Q16798 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME3Q16798 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME3Q16798 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME3Q16798 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME3Q16798 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME3Q16798 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME3Q16798 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ME3Q16798 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ME3Q16798 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME3Q16798 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME3Q16798 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ME3Q16798 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ME3Q16798 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME3Q16798 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ME3Q16798 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ME3Q16798 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ME3Q16798 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ME3Q16798 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ME3Q16798 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ME3Q16798 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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