Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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