Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CARTPTQ16568 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms