Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYPL1Q16563 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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