Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ETFDHQ16134 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFDHQ16134 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms