Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ZNF56Q15929 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ZNF56Q15929 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ZNF56Q15929 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ZNF56Q15929 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF56Q15929 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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