Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF2Q15853 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
USF2Q15853 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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