Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

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Length 3,267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPEGQ15772 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms