Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SF1Q15637 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SF1Q15637 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SF1Q15637 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SF1Q15637 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SF1Q15637 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SF1Q15637 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SF1Q15637 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SF1Q15637 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SF1Q15637 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SF1Q15637 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SF1Q15637 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SF1Q15637 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SF1Q15637 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SF1Q15637 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SF1Q15637 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SF1Q15637 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SF1Q15637 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SF1Q15637 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SF1Q15637 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SF1Q15637 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SF1Q15637 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SF1Q15637 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SF1Q15637 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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