Protein–RNA interactions for Protein: Q15303

ERBB4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB4Q15303 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB4Q15303 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.47
ERBB4Q15303 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms