Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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GBX1Q14549 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBX1Q14549 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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