Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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COL9A2Q14055 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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COL9A2Q14055 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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COL9A2Q14055 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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COL9A2Q14055 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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COL9A2Q14055 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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