Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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PDE6HQ13956 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PDE6HQ13956 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PDE6HQ13956 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PDE6HQ13956 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PDE6HQ13956 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PDE6HQ13956 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PDE6HQ13956 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PDE6HQ13956 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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