Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms