Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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