Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMC2Q13753 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMC2Q13753 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMC2Q13753 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMC2Q13753 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMC2Q13753 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMC2Q13753 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMC2Q13753 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMC2Q13753 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMC2Q13753 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMC2Q13753 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMC2Q13753 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMC2Q13753 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMC2Q13753 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMC2Q13753 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMC2Q13753 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMC2Q13753 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMC2Q13753 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMC2Q13753 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMC2Q13753 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMC2Q13753 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms